Desde 2002, a Prodesp investe em certificações ISO com o intuito de profissionalizar e promover a gestão de processos.
Atualmente, a empresa é certificada em gestão da qualidade (ISO 9001), gestão da segurança da informação (ISO 27001), gestão de serviços de TI (ISO 20000) e gestão ambiental (ISO 14001).
Em 2010, em uma ação inédita no mundo, a Prodesp promoveu, com base na norma internacional PAS 99, a consolidação dos quatro sistemas de gestão em um único, o Sistema Integrado de Gestão de TI, com as seguintes Diretrizes:
